吴奇隆的前妻是马雅舒，算是内地还小有名气的女演员吧。2001年吴奇隆和内地女星马雅舒通过拍摄《萧十一郎》相识，马雅舒先追的吴奇隆，吴奇隆因为那时刚到内地发展，对于从小就渴望家的温暖的吴奇隆来说，因为马雅舒对吴奇隆的悉心照顾和温柔体贴，所以很快就发展成恋人了。
2006年12月12日，吴奇隆与马雅舒登记结婚。这段婚姻维持不到三年，终因两人长时间聚少离多而告终。但尚未办妥离婚手续，马雅舒却传出和外籍男友出双入对已达一年多，且多次被媒体拍到与外籍男友出入跟同居。吴奇隆在媒体问及时说：“这种私生活被曝光，已经是很丢人的事了，所以放了别人，自己工作也自由。”吴奇隆与马雅舒已于2009年8月11日正式办理离婚手续，作为一个向来善良大度有责任心的好男人，吴奇隆在离婚时还是把几乎能给的财产跟房产都给了马雅舒。
吴奇隆现任女友是刘诗诗
2015年1月20日，吴奇隆发布微博晒结婚证和结婚戒指。刘诗诗第一时间转发了这条，并称“我们很幸福”。刘诗诗与吴奇隆2011年因为出演《步步惊心》，成炙手可热的荧屏情侣。2012年6月15日，吴奇隆、刘诗诗获得上海电视节白玉兰奖观众票选最高人气男女演员时，两人在台下有牵手等亲密互动。但吴奇隆回台湾时接受采访称没有和刘诗诗谈恋爱。2013年8月，吴奇隆与刘诗诗再合作《犀利仁师》。8月8日晚，刘诗诗从义乌乘飞机抵达北京。10小时后，她又与吴奇隆一同出现在机场，一起飞往杭州。11月9日，两人再次被拍到在上海深夜相约。面对愈演愈烈的传闻，吴奇隆终于在11月13日承认恋情。
吴奇隆与刘诗诗正式于微博上承认恋情后，不少明星都送上祝福。“步步惊心”家族的袁弘、石小群、叶祖新、郭珍霓等都开心两人终成眷属。特别是与吴奇隆曾传过绯闻的马苏在微博上为两人撒花，“一睁开眼睛看到这么一个天大的好消息，真是高兴的在床上连打了好几个滚儿，葛隔，祝福你们哟，天造地设的一对…!什么时候喝喜酒撒…鼓掌撒花”。
而吴奇隆的好哥们小虎队成员也不甘人后，苏有朋就在微博上直呼，霹雳虎的新恋情让他又相信爱情了。——“我又相信爱情了啊![得意地笑]永远支持!!@吴奇隆TD”而更有陈妍希、李晨、刘涛、颖儿、陈龙、朱丹、孙艺洲、马天宇、大左等两人诸多圈内好友也送上祝福。昨天，吴奇隆的宣传人员透露，吴奇隆和刘诗诗马上要进组工作了，他们的工作已经安排到今年下半年，因此办婚礼的事未提上日程。在二人发布婚讯后不久，马天宇为二人送上祝福，还称要“祝好孕”。不少网友揣测二人奉子成婚。刘诗诗的宣传人员否认其怀孕消息：“当然没有。她马上进组拍《黎明决战》。”
